У Вас шерсть у шиншиллы в ужасном состоянии. Я имею ввиду общий вид, а не лысеющие места.
Возможно, нарушение обмена веществ. На грибок очень похоже, но, по моему мнению, он - следствие.
Сейчас имеет смысл добавить в питание витаминчиков (можно магазинных, а лучше хорошенько подсушить молодой травки - весна на дворе!). Имунал по таблеточке два раза в день в лапки. Местно я предпочитаю много компонентные мази(Тридерм,Акридерм) с антибиотиком,гормоном и противогрибковым препаратом.
Напишите подробнее о том, чем кормите. Возможно имеет смысл что-то подкорректировать.
Главное - не пугайтесь. Это не так страшно, как выглядит и звучит. Поправляются и обрастают шилки быстро. При соблюдении элементарных правил гигиены Вам ничего не грозит.
Выздоравливайте.